РАДИОЛОГИЧЕСКИЙ ПОРТАЛ
  радиология человека и животных 



  to do to see and to describe
 

Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Обсуждаем, рекомендуем, ищем способы осуществления...

Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 01 фев 2012, 00:01

Пояснения:
1) Это руководство для тех, кто переснял плёночную рентгенограмму на цифромыльницу, и не знает как с помощью компьютера сделать её лучше.
2) Здесь будет рассказано, в какой последовательности, что и как делать в фотошопе.
3) Рассказываю о том, что делаю сам.
4) Рассказываю, для того, чтобы те, кто не знает как подступиться к обработке рентгенограмм в фотошопе, могли начать что-то делать.
5) Большинство задач по улучшательству картинок в растровых редакторах можно решить несколькими способами. Главное — не бояться пробовать.
6) Для более глубокого изучения предмета — есть смысл читать книжки и искать в интернете руководства написанные специалистами по цифровой обработке изображений.
7) Фотошоп выбран потому, что его пиратская копия есть практически у каждого. Если будет востребовано, напишу такое же руководство по правке картинок в GIMP. Хотя, в GIMP'е всё почти так же.

Исправить можно далеко не всё:
1) Можно попытаться сделать видимым невидимое, но не получится сделать видимым отсутствующее. Если исходный снимок настолько бледный, что (к примеру) рёбра, накладывающиеся на печень не видны, не расчитывайте, что после цифровой обработки вы сможете их увидеть. То же насчёт очень тёмных рентгенорамм.
2) Если рентгенограмма «смазана» из-за шевеления животного во время рентгена (динамическая нерезкость) — улучшить её не получится.
3) Если рентгенограмма хорошая, но при съёмке на цыфромыльницу картинка получилась плохой — лучше попытаться пофотографировать её ещё, добиваясь максимально хорошей картинки.
4) Старайтесь получить максимальное качество картинки на всех этапах (выполнение рентгенологического исследования, обработка рентгенограммы, пересъемка рентгенограммы на цыфромыльницу). Чем меньше придётся править — тем лучше.
5) Любое лишнее преобразование и сохранение изображения, это шанс потерять какие-то детали.

Последовательность действий, которые мы будем делать:
повернуть как надо ==> обрезать лишнее ==> сделать при необходимости позитив из негатива ==> сделать белое белым а чёрное чёрным ==> поиграться с яркостью-контрастностью ==> при необходимости увеличить резкость ==> уменьшить размеры если надо.

Ну, теперь подробно:
1) Открываем картинку фотошопом. < File \ Open... >

2) Повернём как нужно, если нужно — отразим зеркально: < Image \ Rotate canvas >

3) Обрезаем лишнее (кадрируем). Используем Crop Tool.

Crop Tool'ом выделяем на картинке прямоугольник который нам нужен, его можно порастягивать за серединки сторон или углы (там есть маленькие квадратики, за них надо цепляться курсором), поместив курсор вблизи угла (снаружи) можно понаклонять. Когда нужное выделено, жмём <Enter> — обрезаем.

4) Нам не нужна цветная картинка, достаточно картинки в градациях серого
Уберём цвета < Image \ Mode \Grayscale >:

(Продолжение следует)
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 01 фев 2012, 00:06

5) Позитив из негатива (довольно удобно позитивное изображение для рентгенограмм грудной клетки и для многих исследований с введением контраста) делаем так: < Image \ Adjustments \ Invert >

6) А теперь используем инструмент Levels. Он выводит яркостную гистограмму картинки и позволяет поработать с ней. Находится здесь < Image \ Adjustments \ Levels … >:

Сначала научимся понимать этот график. На гистограмме показано сколько пикселей различной яркости имеется на картинке. По горизонтали графика уровни яркости отображаемые компьютером, от абсолютной тьмы слева до самого яркого света справа, между ними оттенки серого (наша картинка уже не имеет цветов). По вертикали - сколько пикселей соответствующей яркости имеется на картинке.
вот примеры, для того, чтобы понять:

То есть: чем шире гистограмма — тем лучше (тем больший диапазон яркостей охвачен картинкой), чем левее лежит гистограмма — тем темнее картинка, чем правее — тем светлее.
Картинка сделана правильно, если гистограмма занимает всю ширину яркостей, плавно опускаясь до нуля у самых краёв. Если график узкий — значит черное и белое на изображении очень близки по яркости — то есть картинка не контрастна. Если узкая гистограмма лежит не по центру, значит картинка не только малоконтрастна, но ещё и слишком светлая или слишком тёмная. Если гистограмма не сходит на нет у левого или правого края, значит она выходит за пределы отображаемых яркостей, значит какую то часть информации мы на каком-то этапе потеряли. Что-то оказалось темнее-тёмного или светлее-светлого («бледнее бледного»).

(Продолжение следует)
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 01 фев 2012, 00:10

7) А теперь попробуем сделать самый тёмный участок картинки чёрным, а самый светлый участок — белым. Для этого подвинем треугольные движки под горизонталью к местам где начинается и кончается гистограмма. Этим мы покажем фотошопу, какой оттенок серого с нашей картики должен стать чёрным, а какой — белым.

Можно попробовать сделать то же самое черной и белой пипетками. Выбираем чёрную или белую пипетку, которыми берём соответственно образец самого тёмного или самого светлого участка рентгенограммы (образец самого тёмного цвета брать с пустого участка рентгенограммы, образец самого светлого — с чего-нибудь максимально плотного — например с лежащей на снимке буквенной метки «лево-право»), есть смысл потыкаться пипетками несколько раз — то что глазом видно как «самый чёрный» или «самый белый» цвета — для компьютера может оказаться «не самым».

Смотрим на предпросмотр, когда всё устраивает — применяем.
Если интересно — снова смотрим Levels, чтобы оценить результат.
Можно попробовать поиграться со средним движком (или, соответственно, с серой пипеткой) — им можно сделать картинку более светлой или более тёмной.
Когда поймёте, что именно меняется при смене положения движков, можете попробовать править гистограмму автоматически: < Image \ Adjustments \ Auto Levels >

8) Настраиваем яркость-контрастность. Это делается здесь: < Image \ Adjustments \ Brightness/Contrast >

Насколько двигать движки - писать бесполезно. Пробуйте и наблюдайте результат. Надеюсь на ваше чувство меры — следите за тем, чтобы не потерять значимых деталей. С другой стороны, если нужно особенно выделить какой-то объект на рентгенограмме, можно сильно задрать контраст и пренебречь деталями, но не забудьте сохранить и картинку в варианте с более умеренным контрастом.

(Окончание следует)
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 01 фев 2012, 00:16

9) Повышение резкости — это пожалуй наиболее востребованная рентгенологами группа фильтров. Живёт здесь: < Filter \ Sharpen... >:

Там их несколько. Пожалуй интереснее всего применять фильтр, который называется Smart Sharpen.

Не пугайтесь настроек: подвигайте движки, пронаблюдайте результат. Уверен, вы разберётесь минут за 10 - 15. Может быть, после игр с этим фильтром, у вас появятся мысли, откуда берутся некоторые артефакты на цифровых рентгенограммах...

10) Для публикации на сайте есть смысл сделать картинку поменьше. Это делается здесь:

Здесь всё просто: выбираем единицу измерения — пикселы, выбираем какая нужна высота или ширина. Меньше 400х600 делать не стоит. Желательно, чтобы картинка развёрнутая в масштабе 1:1 помещалась в разрешение монитора среднего пользователя, то есть не превышала ширину или высоту. Какое разрешение на мониторе среднего пользователя? Ориентируйтесь на себя. Вот я пишу сюда с нетбука с экраном 1024х600, и картинки режу по ширине до 900 или 1000 пикселей.

11) Да, не забудте сохранить у себя исходную картинку! Ту, которую получили с камеры и совсем не исправляли — вдруг придётся править её с другими настройками!
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Dr.Vet » 24 июн 2013, 16:52

Спасибо,очень интересная информация.
Вопрос : можно ли чертить стрелки ,измерять расстояния обьектов?
Аватара пользователя
Dr.Vet
 
Сообщения: 6
Зарегистрирован: 09 май 2013, 20:10
Cпециальность: Хирургическая специальность

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 24 июн 2013, 18:03

Измерять расстояния на фотографии, сделанной с плёночного снимка - это вряд ли (откуда шопу знать, каких размеров был снимаемый объект).

Если обрабатывать картинку с оцифровщика - логичнее перед выводом картинки в графический файл, померить и выставить размеры.
Если картинка с оцифровщика, то говорят, что есть плугин к шопу, для работы с dicom-файлами. Не пробовал.

Стрелки рисовать в шопе можно, и надписи делать можно. Рисовал в нём стрелки пару раз.
Мой выбор для рисования стрелок, отметок, обводки контуров - Xara. Ну или другой какой векторный редактор. Но ничего проще, быстрее и удобнее Xara я не нашёл (да уже и не ищу). Будут нужны подробности - спрашивайте.
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Darvin » 08 июл 2013, 22:41

Спасибо за совет!Можно ли на этой программе измерять угол,например на снимках ТБС?Скиньте ссылку на программу,буду благодарен.
Аватара пользователя
Darvin
Специалист
 
Сообщения: 86
Зарегистрирован: 02 июн 2013, 21:27
Откуда: Польша , Gdow
Cпециальность: Хирургическая специальность

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 08 июл 2013, 23:39

Это Вам смотреть в сторону адоб-иллюстратора или корел-дро... Ну или автокада (кроме шуток: http://www.arsveterinaria.org.br/index.php/ars/article/viewFile/292/356).

В xare можно измерить углы так (простите за кривое объяснение, если не поймёте, то сделаю видео):
1) рисуем отрезок по первой стороне угла
2) дублируем отрезок, помещаем на первый отрезок
3) выбираем вращение второго отрезка, переносим центр вращения в угол, который будем измерять
4) вращаем второй отрезок на сколько нужно, смотрим циферки в окошке "поворот".


Брать на торрентах. Я пользуюсь этой: http://rutracker.org/forum/viewtopic.php?t=1904489
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Darvin » 09 июл 2013, 19:11

Cпасибо за совет!Будем пробовать.
Аватара пользователя
Darvin
Специалист
 
Сообщения: 86
Зарегистрирован: 02 июн 2013, 21:27
Откуда: Польша , Gdow
Cпециальность: Хирургическая специальность

Re: Как обработать рентгенограмму в фотошопе

Сообщение Gerasimov » 10 июл 2013, 00:34

Если непонятки какие - спрашивайте.
Аватара пользователя
Gerasimov
Модератор (вет)
 
Сообщения: 2466
Зарегистрирован: 22 окт 2011, 20:09
Откуда: СПб
Cпециальность: Радиолог (ветеринария)

След.

Вернуться в Нормативно-правовые акты по радиологии

Кто сейчас на конференции

Сейчас этот форум просматривают: Google Adsense [Bot] и гости: 1

© 2014 Радиологический Портал